Jak už to tak v zemi vycházejícího slunce bývá, Yui Kusanagi je naprosto obyčejná středoškolačka, snad jen na to, že prakticky pořád tahá přes rameno meč, se kterým odmalička cvičí a že její rodina bydlí v chrámu. Jednoho krásného dne se pak Yui vrací domů, uslyší hlas, který volá její jméno. Když pak uvidí, že ze skladu vychází zvláštní modré světlo, samozřejmě udělá to, co každý běžný smrtelník - vleze dovnitř. Když uvnitř objeví zvláštní meč a snaží se ho vzít do ruky, ztratí vědomí. Když se probere, zjišťuje, že je nejen v jiné místnosti, ale někde úplně jinde a vypadá to, že nejspíš ani není na Zemi. Když se snaží zorientovat v nové situaci, potkává několik mladíků, z nichž někteří nejsou zrovna příjemní a někteří jsou naopak příjemní až moc. Nakonec se ale konečně ukazuje ten, kdo je za všechno zodpovědný, a není jím nikdo jiný než sám Zeus, vládce bohů. Ten pak Yui vysvětluje, jak se má současná situace - pouta, která odjakživa byla mezi lidmi a bohy, už dávno nejsou to, co býva...